(Luận văn thạc sĩ) Giải pháp song song cho vấn đề gom cụm trình tự Metagenomic
➤ Gửi thông báo lỗi ⚠️ Báo cáo tài liệu vi phạmNội dung chi tiết: (Luận văn thạc sĩ) Giải pháp song song cho vấn đề gom cụm trình tự Metagenomic
(Luận văn thạc sĩ) Giải pháp song song cho vấn đề gom cụm trình tự Metagenomic
LỜI CAM ĐOANTỏi cam đoan đày lá còng trình nghiên cứu của tỏi.Các số liệu, kết qua nêu trong luận văn là trung thực và chưa từng được ai công bố trong (Luận văn thạc sĩ) Giải pháp song song cho vấn đề gom cụm trình tự Metagenomic g bất kỳ công trình nào khácTp. Hồ Chi Minh, ngày 20 thảng 3 nảm 202ỉiiiLÒI CẢM ƠNĐẻ có thẻ hoàn thành tốt luận văn nảy. trước tiên tói xin chân thành gửi lời căm ơn đến TS. Lê Văn Vinh. Thầy đà luôn tận tâm chi báo và hướng dẫn tôi trong suốt thời gian tôi thực hiện luận văn này.Tôi cũng xin căm ơn (Luận văn thạc sĩ) Giải pháp song song cho vấn đề gom cụm trình tự Metagenomic Thay Phạm Tuan Hiệp, đã hồ trợ tòi các hệ thong máy chủ đê tiến hành thực nghiệm nghiên cứu này.Tôi xin cám ơn các Quỷ Thầy Cô. những người đà trực t(Luận văn thạc sĩ) Giải pháp song song cho vấn đề gom cụm trình tự Metagenomic
iếp và gián tiếp chi bao và giang day giúp tôi có những kiến thức cẩn thiết để thực hiện luận văn này.Tôi cũng xin câm ơn gia đinh vã bạn bẽ đã quan tLỜI CAM ĐOANTỏi cam đoan đày lá còng trình nghiên cứu của tỏi.Các số liệu, kết qua nêu trong luận văn là trung thực và chưa từng được ai công bố trong (Luận văn thạc sĩ) Giải pháp song song cho vấn đề gom cụm trình tự Metagenomic line that allows the direct study of genetic materials collected from cnvhonmcnts without isolating and culturing single organisms, rhe study can help US deeply understand microbial communities and thus brings benefits in many fields, e.g. biotechnology, earth science, agriculture. Some early metage (Luận văn thạc sĩ) Giải pháp song song cho vấn đề gom cụm trình tự Metagenomic nomic projects use whole genome shotgun sequencing methods with Sanger sequencing technology. However, the technique is expensive and lakes a long lim(Luận văn thạc sĩ) Giải pháp song song cho vấn đề gom cụm trình tự Metagenomic
e to produce sequences, while each project has to sequenced a large amount of DNA content. Thanks to the development of the next-generation sequencingLỜI CAM ĐOANTỏi cam đoan đày lá còng trình nghiên cứu của tỏi.Các số liệu, kết qua nêu trong luận văn là trung thực và chưa từng được ai công bố trong (Luận văn thạc sĩ) Giải pháp song song cho vấn đề gom cụm trình tự Metagenomic ome feasible. However, it also poses a computational challenge for research communities.Due to a fact that microbial samples derived from their communities are sequenced directly without the isolation in laboratories, metagenomic datasets contain sequences belonging to different organisms. Thus, one (Luận văn thạc sĩ) Giải pháp song song cho vấn đề gom cụm trình tự Metagenomic of the important tasks in metagenomic projects which is referred to as "binning" is to classify sequences into groups of closely related organisms.Bi(Luận văn thạc sĩ) Giải pháp song song cho vấn đề gom cụm trình tự Metagenomic
nning algorithms can be put into two categories of supervised and unsupen ised methods. Supervised methods use databases of available microbial sequenLỜI CAM ĐOANTỏi cam đoan đày lá còng trình nghiên cứu của tỏi.Các số liệu, kết qua nêu trong luận văn là trung thực và chưa từng được ai công bố trong (Luận văn thạc sĩ) Giải pháp song song cho vấn đề gom cụm trình tự Metagenomic egics. Those unsupervised methods focus on the aspect of classification quality, but do not take computational performance into consideration.This work proposes a parallelized binning algorithm integrating MFI and multithreading technologies, which is quite efficient to solve large metagenomic probl (Luận văn thạc sĩ) Giải pháp song song cho vấn đề gom cụm trình tự Metagenomic ems that are both data-intensive and compute-intensive. Experimental resultsindicate that the proposed method is able to reduce much computational tim(Luận văn thạc sĩ) Giải pháp song song cho vấn đề gom cụm trình tự Metagenomic
e and utilize resources of high-performance systems efficiently.ViTÓM TẢTLình vực metagenomics trực tiếp giãi trình tụ và phân tích thông tin hệ gen tLỜI CAM ĐOANTỏi cam đoan đày lá còng trình nghiên cứu của tỏi.Các số liệu, kết qua nêu trong luận văn là trung thực và chưa từng được ai công bố trong (Luận văn thạc sĩ) Giải pháp song song cho vấn đề gom cụm trình tự Metagenomic tích cấu trúc chức năng cho tẩt cã các hệ gen trong một cộng đong vi sinh vật. Với sự tiền bộ của các kỹ thuật giái trinh tự thế hệ tiếp theo (Next Generation Sequencing - NGS), số lượng mầu metagenomic và kích thước dữ liệu cho mồi mầu đang tâng lên nhanh chóng. Thách thức trong phân tích dừ liệu (Luận văn thạc sĩ) Giải pháp song song cho vấn đề gom cụm trình tự Metagenomic metagenomic hiện tại bao gom vấn đề cã về độ chính xác và chi phí tinh toán, đặc biệt là khi có nhiều loài trong một mầu metagenomic và môi loài có mộ(Luận văn thạc sĩ) Giải pháp song song cho vấn đề gom cụm trình tự Metagenomic
t so lượng lớn các trinh tự.Một nhiệm vụ quan trọng trong cốc dự án metagenomic là bãi toán gom cụm trình tự cua các loài có quan hệ gần nhau. Các giáLỜI CAM ĐOANTỏi cam đoan đày lá còng trình nghiên cứu của tỏi.Các số liệu, kết qua nêu trong luận văn là trung thực và chưa từng được ai công bố trong (Luận văn thạc sĩ) Giải pháp song song cho vấn đề gom cụm trình tự Metagenomic m sát sư dụng cơ sơ dữ liệu cua các loài đã biết dê gom cụm. Do thưc tế là đa số các loài vi sinh vật chưa được biết đến nên nhiều giái pháp đã sữ dụng chiên lược học không giám sát. Các giãi pháp không giám sát này chu yếu chú trong đến chất lương gom cụm mà không quan tâm đến hiệu năng tính toán.N (Luận văn thạc sĩ) Giải pháp song song cho vấn đề gom cụm trình tự Metagenomic ghiên círu này đề xuất một giái pháp song song két hợp vận dụng diêm mạnh cùa công nghệ da nhàn (multi-core) và đa node (multi-node) nhàm đáp ứng nhu(Luận văn thạc sĩ) Giải pháp song song cho vấn đề gom cụm trình tự Metagenomic
cầu phàn tích nhanh chóng và hiệu quà cho việc phân tích dử liệu metagenomic mã cụ thể là bài toán gom cụm trình tự. Các kết quá thực nghiêm cho thấy LỜI CAM ĐOANTỏi cam đoan đày lá còng trình nghiên cứu của tỏi.Các số liệu, kết qua nêu trong luận văn là trung thực và chưa từng được ai công bố trong (Luận văn thạc sĩ) Giải pháp song song cho vấn đề gom cụm trình tự Metagenomic ......................................iLỜI CAM ĐOAN.....................................................iiiLỜI CẤM ƠN........................................................ivABSTRACT...........................................................VTÓM TẤT.................................................. (Luận văn thạc sĩ) Giải pháp song song cho vấn đề gom cụm trình tự Metagenomic ........viiMỤC LỤC.........................................................viiiDANH MỤC CÁC HÌNH.................................................xiDAN(Luận văn thạc sĩ) Giải pháp song song cho vấn đề gom cụm trình tự Metagenomic
H MỤC BẢNG BIỂU...............................................xiiChương 1...........................................................1LỜI CAM ĐOANTỏi cam đoan đày lá còng trình nghiên cứu của tỏi.Các số liệu, kết qua nêu trong luận văn là trung thực và chưa từng được ai công bố trongLỜI CAM ĐOANTỏi cam đoan đày lá còng trình nghiên cứu của tỏi.Các số liệu, kết qua nêu trong luận văn là trung thực và chưa từng được ai công bố trongGọi ngay
Chat zalo
Facebook