Luận văn ứng dụng công nghệ giải trình tự thế hệ mới ion s5 x ltm trong giám định hài cốt lâu năm
➤ Gửi thông báo lỗi ⚠️ Báo cáo tài liệu vi phạmNội dung chi tiết: Luận văn ứng dụng công nghệ giải trình tự thế hệ mới ion s5 x ltm trong giám định hài cốt lâu năm
Luận văn ứng dụng công nghệ giải trình tự thế hệ mới ion s5 x ltm trong giám định hài cốt lâu năm
DANH MỤC BÁNGBảng 1.1: Thống kẻ tý lệ đột biến ở hệ gen ty thè......................16Bang 1.2 Tông hợp một số công nghệ giai trinh tự the hệ mới .... Luận văn ứng dụng công nghệ giải trình tự thế hệ mới ion s5 x ltm trong giám định hài cốt lâu năm ........24Bang 2.1. Danh sách 14 cặp môi dùng cho Pool 1 và Pool 2 ..............31Bang 2.2: Danh sách các loại Kit sơ dụng trong chuân bị thư viện.......32Bâng 2.3: Nong độ mẫu xây dựng dường chuẩn:............................35Bâng 2.4: Thành phần phân ứng Realtime PCR............................. Luận văn ứng dụng công nghệ giải trình tự thế hệ mới ion s5 x ltm trong giám định hài cốt lâu năm 35Bâng 2.5: Qui trinh chuẩn bị thư viện thủ công.........................38Bang 2.6 Phương pháp khuếch đại với các loại mau khácnhau.............38BanLuận văn ứng dụng công nghệ giải trình tự thế hệ mới ion s5 x ltm trong giám định hài cốt lâu năm
g 3.1: Thành phân PCR khuếch đại các đoạn gcb đê tạo thư viện.......49Bâng 3.2: Nong độ pha loăng thư viện...................................52Bảng 3.DANH MỤC BÁNGBảng 1.1: Thống kẻ tý lệ đột biến ở hệ gen ty thè......................16Bang 1.2 Tông hợp một số công nghệ giai trinh tự the hệ mới .... Luận văn ứng dụng công nghệ giải trình tự thế hệ mới ion s5 x ltm trong giám định hài cốt lâu năm g tông hợp kết qua giãi trinh lự NGS củachip1và chip 2.59Bang 3.7: Tiêu chí đánh giá chai lượng giai trinh lự...................62Bâng 3.8: Phân loại đánh giá kết quà Sanger và S5......................63Bâng 3.9: Bảng tong họp các mầu phát hiện có vùng bịphànhủy thông quaphưo-ng pháp dọc trình tự Io Luận văn ứng dụng công nghệ giải trình tự thế hệ mới ion s5 x ltm trong giám định hài cốt lâu năm n Torrent S5...............................661ĐẠT VẮN ĐẺHiện nay trên thể giới có hàng triệu người mất tích do chiến tranh, thiên tai. (ai nạn máy bayLuận văn ứng dụng công nghệ giải trình tự thế hệ mới ion s5 x ltm trong giám định hài cốt lâu năm
... chưa xác định được danh linh. Ricng ờ Viet Nam. dù chiến tranh đà kèt thúc hem 40 nam. nhung hậu quà chiên tranh đe lại vô cùng nặng ne. Theo so lDANH MỤC BÁNGBảng 1.1: Thống kẻ tý lệ đột biến ở hệ gen ty thè......................16Bang 1.2 Tông hợp một số công nghệ giai trinh tự the hệ mới .... Luận văn ứng dụng công nghệ giải trình tự thế hệ mới ion s5 x ltm trong giám định hài cốt lâu năm rong dó hơn 300.000 hài cốt dà dược quy tập và an táng tại các nghĩa trang liệt sì và khoang 200.000 hài CÔI chưa được quy tập về các nghĩa trang liệt sĩ mà nam rai rác ớ các tinh phía Nam. Lào và Campuchia [1][2]. rhông thường, hệ gen nhân cho phép dinh danh chinh xác den từng cá the thòng qua các Luận văn ứng dụng công nghệ giải trình tự thế hệ mới ion s5 x ltm trong giám định hài cốt lâu năm đoạn lặp từ 2-6 nucleotide SI R (Short 1 andem Repeat) trên cảc locus khác nhau của bộ nhiễm sac the. Tuy nhiên, dối với các mầu hãi cot lâu năm. cácLuận văn ứng dụng công nghệ giải trình tự thế hệ mới ion s5 x ltm trong giám định hài cốt lâu năm
phần mô. xương bị phân huy mạnh do anh hưởng bởi các điêu kiện môi trường (nhiệt độ. ƯV, pH, các thành phàn vò cơ và hệ vi sinh vật), dần den toàn bộ DANH MỤC BÁNGBảng 1.1: Thống kẻ tý lệ đột biến ở hệ gen ty thè......................16Bang 1.2 Tông hợp một số công nghệ giai trinh tự the hệ mới .... Luận văn ứng dụng công nghệ giải trình tự thế hệ mới ion s5 x ltm trong giám định hài cốt lâu năm a vảo phân tích AĐN ty the (Mitochondiral ĐNA -m(ADN), bơi cấu trúc dạng vòng giúp loại ADN này bền hơn dưới tác động cua môi trường [3].Việc xác dịnh danh tinh dựa trên việc so sánh các nucleotide ờ vùng siêu biến (I IV1, IIV2 vả IIV3) thuộc hệ gen ty thế của hài cot vói thân nhàn. Phương pháp giai Luận văn ứng dụng công nghệ giải trình tự thế hệ mới ion s5 x ltm trong giám định hài cốt lâu năm trinh tự ADN ty thè dùng trong giám định đang được sư dụng phô biên ờ Việt Nam hiện nay, cũng như ờ một so phòng thí nghiệm trên the giới đều dựa trêLuận văn ứng dụng công nghệ giải trình tự thế hệ mới ion s5 x ltm trong giám định hài cốt lâu năm
n nguyên lý Sanger. Ưu điểm cua phương pháp này là dễ thực hiện, giá thành ré. Tuy nhiên, giãi trình tự Sanger dọc dược ít mẫu. dộ lặp lại thấp, chất DANH MỤC BÁNGBảng 1.1: Thống kẻ tý lệ đột biến ở hệ gen ty thè......................16Bang 1.2 Tông hợp một số công nghệ giai trinh tự the hệ mới .... Luận văn ứng dụng công nghệ giải trình tự thế hệ mới ion s5 x ltm trong giám định hài cốt lâu năm phan ứng giai trinh lự bang phương pháp Sanger tương đối cao (~10 ng/pl) [4].Đo dó, nhàm nâng cao năng suất, độ chính xác cùng như tận dụng dược các ưu thế vượt trội cúa hệ thống đọc trinh tự thế hệ mới (NGS) trong công2tác giám định hãi cốt liệt sĩ ờ Việt Nam, chúng tôi thực hiện đề tài “ưng dụng c Luận văn ứng dụng công nghệ giải trình tự thế hệ mới ion s5 x ltm trong giám định hài cốt lâu năm óng nghê giãi trình tự the mởi Ion Torrent S5XL™ trong việc giám định hài cot lâu năm” . Nghiên cứu nãy sử dụng bộ kit Precision 11) mtADN Control RegLuận văn ứng dụng công nghệ giải trình tự thế hệ mới ion s5 x ltm trong giám định hài cốt lâu năm
ion Panel (Thcnnoíĩshcr) dựa trên hệ thong giai trinh tự thế hệ mới (NGS) IonS5-XL. Thông qua việc sư dụng 14 cặp môi với các biến thê khác nhau, dã tDANH MỤC BÁNGBảng 1.1: Thống kẻ tý lệ đột biến ở hệ gen ty thè......................16Bang 1.2 Tông hợp một số công nghệ giai trinh tự the hệ mới .... Luận văn ứng dụng công nghệ giải trình tự thế hệ mới ion s5 x ltm trong giám định hài cốt lâu năm ADN dầu vào chi khoáng 2 pg. Vời coverage ~ 200x, phương pháp này có thè giai quyết khó khán khi phân lích các diem Heteroplasmies and Poly-Cylosine [5].Đe tài dược thực hiện tại Trung tâm Giám dinh ADN, Viện (ong nghệ Sinh học với hai mục tiêu:/. Xây dụng quy trình chạy và hước đầu áp dụng phương Luận văn ứng dụng công nghệ giải trình tự thế hệ mới ion s5 x ltm trong giám định hài cốt lâu năm pháp giải trình tự thê hệ mỏi (NGS) dê giảm dinh ADN hài cốt lâu nòm.2. Phân rích dược dừ liệu vùng siêu biên ADN ty thề cùa các mẫu nghiên cứu tù cácLuận văn ứng dụng công nghệ giải trình tự thế hệ mới ion s5 x ltm trong giám định hài cốt lâu năm
kết quá thu được thông qua hệ thong giai trình tự the hệ mới (XGS).3CHƯƠNG 1. TỎNG QUAN TÀI LIỆU1.1 DẠC ĐIÉM GIÃI PHÁƯ VÀ MÒ HỌC XƯƠNG1.1.1 Thành phầDANH MỤC BÁNGBảng 1.1: Thống kẻ tý lệ đột biến ở hệ gen ty thè......................16Bang 1.2 Tông hợp một số công nghệ giai trinh tự the hệ mới .... Luận văn ứng dụng công nghệ giải trình tự thế hệ mới ion s5 x ltm trong giám định hài cốt lâu năm ica, IneHình 1.1: Bộ xương người (nhìn íừphia n ước) [7]+ Xương mình gôm có:DANH MỤC BÁNGBảng 1.1: Thống kẻ tý lệ đột biến ở hệ gen ty thè......................16Bang 1.2 Tông hợp một số công nghệ giai trinh tự the hệ mới ....Gọi ngay
Chat zalo
Facebook