Xác định các chất điều chỉnh chính trong ung thư tuyến tụy bằng cách sử dụng thuật toán tiến hóa
➤ Gửi thông báo lỗi ⚠️ Báo cáo tài liệu vi phạmNội dung chi tiết: Xác định các chất điều chỉnh chính trong ung thư tuyến tụy bằng cách sử dụng thuật toán tiến hóa
Xác định các chất điều chỉnh chính trong ung thư tuyến tụy bằng cách sử dụng thuật toán tiến hóa
UNIVERSITE NATIONALE DU VIETNAM, HANOI INSTITUT DE LA FRANCOPHONIE POUR L’INNOVATION (Renommé de I’Institut Francophone International, IFI)FOTSING SIK Xác định các chất điều chỉnh chính trong ung thư tuyến tụy bằng cách sử dụng thuật toán tiến hóa KADIE GERVAIS SERTILANGEIdentification des principaux régulateurs dans le cancer du pancreas en utiiisant les algorithmes evolutifs.Xác định các chất điêu chinh chính trong ung thư tuyên tụy bằng cách sử dụng thuật toán tiến hóaMEMOIRE DE FIN D’ETUDES DU MASTER INFORMATIQUEHANOI-2018UNIVERSITE NATIO Xác định các chất điều chỉnh chính trong ung thư tuyến tụy bằng cách sử dụng thuật toán tiến hóa NALE DU VIETNAM, HANOI INSTITUT DE LA FRANCOPHONIE POUR ^INNOVATION (Renoniiné de rinstitut Francophone International, IFI)FOTSING SIKADIE GERVAIS SERXác định các chất điều chỉnh chính trong ung thư tuyến tụy bằng cách sử dụng thuật toán tiến hóa
TILANGEIdentification des principaux régulateurs dans le cancer du pancreas en utilisant les algorithmes evolutifs.Xác định các chất điêu chinh chính UNIVERSITE NATIONALE DU VIETNAM, HANOI INSTITUT DE LA FRANCOPHONIE POUR L’INNOVATION (Renommé de I’Institut Francophone International, IFI)FOTSING SIK Xác định các chất điều chỉnh chính trong ung thư tuyến tụy bằng cách sử dụng thuật toán tiến hóa UDES DU MASTER INFORMATIQUE-Sous la direction de: DR Claude PASQUIER et Dr Denis PALLEZAvis favorable à la soutenance:HANOI-2018ATTESTATION SUR L’HONNEURJ’atteste sur 1’honneur que ce mémoire a été realise par moi-même et que les données et les résultats qui y sont présentés sont exacts et n’ont jam Xác định các chất điều chỉnh chính trong ung thư tuyến tụy bằng cách sử dụng thuật toán tiến hóa ais été publies ailleurs. La source des informations citées dans ce mémoire a été bien précisée.LỜI CAM ĐOANTôi cam đoan đây là công trình nghiên cứuXác định các chất điều chỉnh chính trong ung thư tuyến tụy bằng cách sử dụng thuật toán tiến hóa
của riêng tôi.Các sõ liệu, kết quả nêu trong Luận vãn là trung thực và chưa từng dược ai công bố trong bãi kỳ công trình nào khác. Các thông tin tríchUNIVERSITE NATIONALE DU VIETNAM, HANOI INSTITUT DE LA FRANCOPHONIE POUR L’INNOVATION (Renommé de I’Institut Francophone International, IFI)FOTSING SIK Xác định các chất điều chỉnh chính trong ung thư tuyến tụy bằng cách sử dụng thuật toán tiến hóa sõlcctiomicr les sous ensembles de genes liés au cancer du pancróas partant d’un jcux de donnõcs contenant des óchantillons normaux Ct caiiccrcux. Chaquc cchantilloii cst caraclcrise par Ic niveau (I'expression de chaque genes (environ 24000 gôncs). Pour réaliscr cola, on coiLsidcrc 3 eritôrcs quo Xác định các chất điều chỉnh chính trong ung thư tuyến tụy bằng cách sử dụng thuật toán tiến hóa doivent satisfaire les sous-cnsembles de gẻncs séloctionnós. Le premier critóre cst le role du sous-cnscmble select ionné dans 1c cancer <111 pancreasXác định các chất điều chỉnh chính trong ung thư tuyến tụy bằng cách sử dụng thuật toán tiến hóa
. Pour rnatcrialiser mat hemal iquemeni cola, on utilise! SVM pour construirc Illi modclc de classification afin de calculcr la precision du modclc coUNIVERSITE NATIONALE DU VIETNAM, HANOI INSTITUT DE LA FRANCOPHONIE POUR L’INNOVATION (Renommé de I’Institut Francophone International, IFI)FOTSING SIK Xác định các chất điều chỉnh chính trong ung thư tuyến tụy bằng cách sử dụng thuật toán tiến hóa le de gene rctenu doit ôtrc aussi petit quo possible co qui permettra de d’al-legcr la tàchc de verification physique par les biologistcs qui cst par d'aillcurs très coutcusc. Lc dernier critôre cst. la signification biologique des sous ensembles de genes. Pour matórialiscr cola, les sous ensembles Xác định các chất điều chỉnh chính trong ung thư tuyến tụy bằng cách sử dụng thuật toán tiến hóa de genes avec plusieurs interactions biologiques entre cux sont privileges. On a utilise un graphe non oriente dintcractions entre gcncs(bicn comm parXác định các chất điều chỉnh chính trong ung thư tuyến tụy bằng cách sử dụng thuật toán tiến hóa
les biologistcs) donne par la platisformc BioCKlI) 1 Partant. d’un sous ensemble de genes, on calcule le soiis-graphe d’interaction entre les gèncs sUNIVERSITE NATIONALE DU VIETNAM, HANOI INSTITUT DE LA FRANCOPHONIE POUR L’INNOVATION (Renommé de I’Institut Francophone International, IFI)FOTSING SIK Xác định các chất điều chỉnh chính trong ung thư tuyến tụy bằng cách sử dụng thuật toán tiến hóa n un problcmc de leal lire selection. Les donnécs ntilisces dans ce type de problem** out la parlicularitc d'etre de grande dimension( plus de 1(MM) genes) et avec peuxXác định các chất điều chỉnh chính trong ung thư tuyến tụy bằng cách sử dụng thuật toán tiến hóa
SVM-IK’E,LTS,NS(JA2). Nous avons implement*! el teste CCS algorithmes sm quelqucs jeux de donnees. On a propose quclqucs ameliorations pour I'algorithUNIVERSITE NATIONALE DU VIETNAM, HANOI INSTITUT DE LA FRANCOPHONIE POUR L’INNOVATION (Renommé de I’Institut Francophone International, IFI)FOTSING SIK Xác định các chất điều chỉnh chính trong ung thư tuyến tụy bằng cách sử dụng thuật toán tiến hóa cl Li'S amélioré qu’on a pro-posó Ct baptisở : MO LTS. MO LTS cst aussi testé en rcmpla<;ant NSGA2 dans 1c pipeline. Un1. RioGRTD <«l Illi nTen'iiliel d'liih^racl ionXác định các chất điều chỉnh chính trong ung thư tuyến tụy bằng cách sử dụng thuật toán tiến hóa
temps de convergence vers la solution.iiAbstracthl this work, a pipeline is proposed to select subsets of pancreatic cancer genes from a dataset contUNIVERSITE NATIONALE DU VIETNAM, HANOI INSTITUT DE LA FRANCOPHONIE POUR L’INNOVATION (Renommé de I’Institut Francophone International, IFI)FOTSING SIK Xác định các chất điều chỉnh chính trong ung thư tuyến tụy bằng cách sử dụng thuật toán tiến hóa is, we consider .3 criteria that the subsets of select cd genes must satisfy. The first criterion is the role of the selected subset in pancreatic cancer. To mathematically materialize this, we use SVM to construct a classification model in order to calculate the precision of the considered model ju Xác định các chất điều chỉnh chính trong ung thư tuyến tụy bằng cách sử dụng thuật toán tiến hóa st by considering the subset of selected genes as explanatory variables. The second criterion is that the size of the gene sub-set retained should beXác định các chất điều chỉnh chính trong ung thư tuyến tụy bằng cách sử dụng thuật toán tiến hóa
as small as possible, which will make it possible to lighten t he task of physical verification by biologists, which is, by the way, very expensive. TUNIVERSITE NATIONALE DU VIETNAM, HANOI INSTITUT DE LA FRANCOPHONIE POUR L’INNOVATION (Renommé de I’Institut Francophone International, IFI)FOTSING SIK Xác định các chất điều chỉnh chính trong ung thư tuyến tụy bằng cách sử dụng thuật toán tiến hóa between them arc privileged. An undirected graph of gene interactions (well known by biologists) was used by t he BioGRID platform BioGRID is a repository of interaction between genes with data compiled in text files in tabular form Starting from a subset of genes, the subgraph of interaction betwee Xác định các chất điều chỉnh chính trong ung thư tuyến tụy bằng cách sử dụng thuật toán tiến hóa n the selected genes is calculated using the known interaction graph. This problem is a problem of gene selection but can be summarized more generallyXác định các chất điều chỉnh chính trong ung thư tuyến tụy bằng cách sử dụng thuật toán tiến hóa
in a problem of feature selection. The data used in this type of problem have the particularity of being large (more than 1000 genes) and with few inUNIVERSITE NATIONALE DU VIETNAM, HANOI INSTITUT DE LA FRANCOPHONIE POUR L’INNOVATION (Renommé de I’Institut Francophone International, IFI)FOTSING SIK Xác định các chất điều chỉnh chính trong ung thư tuyến tụy bằng cách sử dụng thuật toán tiến hóa s. We went into detail in .3 types of interest ing algorit hms proposed by t he literature (ISVM-RCE, LTS, NSGA2). We have implemented and tested t hese algorithms on some datasets. Some improvements have been proposed for the LTS algorithm. Then a pipeline was proposed for t he selection of importa Xác định các chất điều chỉnh chính trong ung thư tuyến tụy bằng cách sử dụng thuật toán tiến hóa nt genes in pancreatic cancer using the improved NSGA2 and LTS genetic algorithm proposed and named : MO-LTS. MO-LTS is also tested by replacing NSGA2Xác định các chất điều chỉnh chính trong ung thư tuyến tụy bằng cách sử dụng thuật toán tiến hóa
in the pipeline. A biological compliance work is done for the results provided by the two algorithms, and the combination of NSGA2 and .MO-LTS greatlUNIVERSITE NATIONALE DU VIETNAM, HANOI INSTITUT DE LA FRANCOPHONIE POUR L’INNOVATION (Renommé de I’Institut Francophone International, IFI)FOTSING SIKUNIVERSITE NATIONALE DU VIETNAM, HANOI INSTITUT DE LA FRANCOPHONIE POUR L’INNOVATION (Renommé de I’Institut Francophone International, IFI)FOTSING SIKGọi ngay
Chat zalo
Facebook