Luận văn thạc sĩ a maximum likelihood method for detecting bad samples from illumina beadchips data , sử dụng maximum likelihood để xác định mẫu xấu cho dữ liệu illumina beadchips
➤ Gửi thông báo lỗi ⚠️ Báo cáo tài liệu vi phạmNội dung chi tiết: Luận văn thạc sĩ a maximum likelihood method for detecting bad samples from illumina beadchips data , sử dụng maximum likelihood để xác định mẫu xấu cho dữ liệu illumina beadchips
Luận văn thạc sĩ a maximum likelihood method for detecting bad samples from illumina beadchips data , sử dụng maximum likelihood để xác định mẫu xấu cho dữ liệu illumina beadchips
Table of ContentsOverview11Introduction31.1Biological background ....................................... 31.2Sonic common types of mutation .......... Luận văn thạc sĩ a maximum likelihood method for detecting bad samples from illumina beadchips data , sử dụng maximum likelihood để xác định mẫu xấu cho dữ liệu illumina beadchips..................... 51.3SNP and SNP genotype......................................... 61.4Microarray technology and Illumina Beadchips................. 71.5Genotype callers ............................................ 81.6Quality control and quality assurance........................ 91.6.1Identify Luận văn thạc sĩ a maximum likelihood method for detecting bad samples from illumina beadchips data , sử dụng maximum likelihood để xác định mẫu xấu cho dữ liệu illumina beadchips samples with discordant sex information .... 101.6.2Identify samples that have high missing and heterozygosity rate 111.6.3Identify duplicated or relLuận văn thạc sĩ a maximum likelihood method for detecting bad samples from illumina beadchips data , sử dụng maximum likelihood để xác định mẫu xấu cho dữ liệu illumina beadchips
ated samples............... 111.6.1Identify samples that have different ancestries...... 122Genotype callers142.1llluminus............................Table of ContentsOverview11Introduction31.1Biological background ....................................... 31.2Sonic common types of mutation .......... Luận văn thạc sĩ a maximum likelihood method for detecting bad samples from illumina beadchips data , sử dụng maximum likelihood để xác định mẫu xấu cho dữ liệu illumina beadchips..... 182.1Coinparing three callers.................................... 183Maximum likelihood method for detecting bad samples203.1Create potent ial had sample list............................213.2Estimate the fitness of data.................................223.3Remove bad samples................... Luận văn thạc sĩ a maximum likelihood method for detecting bad samples from illumina beadchips data , sử dụng maximum likelihood để xác định mẫu xấu cho dữ liệu illumina beadchips.......................2-14Experimental result254.1Input file format ...........................................254.2Experiment 1.....................Luận văn thạc sĩ a maximum likelihood method for detecting bad samples from illumina beadchips data , sử dụng maximum likelihood để xác định mẫu xấu cho dữ liệu illumina beadchips
............................27TABLE OF CONTENTS ii'1.3 Experiment 2.........................................31Conclusion34Publications35List of FigureTable of ContentsOverview11Introduction31.1Biological background ....................................... 31.2Sonic common types of mutation .......... Luận văn thạc sĩ a maximum likelihood method for detecting bad samples from illumina beadchips data , sử dụng maximum likelihood để xác định mẫu xấu cho dữ liệu illumina beadchipsess of creating and genotyping of Illumina Infinium IlflncOf)]. 82.1Mixture of two Gaussian distributions.......................... 152.2x,y intensities vs. strength ami contrast [TIS+07]............. 173.1The workflow of the method......................................21 Luận văn thạc sĩ a maximum likelihood method for detecting bad samples from illumina beadchips data , sử dụng maximum likelihood để xác định mẫu xấu cho dữ liệu illumina beadchipsTable of ContentsOverview11Introduction31.1Biological background ....................................... 31.2Sonic common types of mutation ..........Gọi ngay
Chat zalo
Facebook