Intégration d’un moteur de workflow sur un environnement de grille
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Intégration d’un moteur de workflow sur un environnement de grille
L’Institut de la Francophonie pour rinfonnatiqueLaboratoire de PhysiqueCoipusculaiie de Clermont-Ferrand# /V ÍP* 3Iwm’Tt»r Pirv!>»o< r Ni’i-tiAWKer »E Intégration d’un moteur de workflow sur un environnement de grille E Pnvsivve nes I’ A ■ r ICI'I r sMaster tie r ITIIntegration d’un Moteur De Workflow sur un Environnement de GrilleMẻrnoừe siư le stage de fin íưétuiỉesprésenté parTRAN Tuan TuStage eííectué au Laboratoũe de Physique Coipusculaire de cleimont-FeilandDirecteur: M. V’incent BRETON - Directeur de Reche Intégration d’un moteur de workflow sur un environnement de grille rche. CNRSHanoi. Octobre 2008.Mémoire de fill d’etudeIntegration d un inoteui de workflow SIU un enviroiineinent de grilleRemerciementsJe tiens d'aborIntégration d’un moteur de workflow sur un environnement de grille
d à remercier Monsieur le Dữecteur de Recherche Dr. Vincent BRETON qui m’a dirigé mon mémoire de fin d'etudes. Sans son initiative, ce stage n’aurait L’Institut de la Francophonie pour rinfonnatiqueLaboratoire de PhysiqueCoipusculaiie de Clermont-Ferrand# /V ÍP* 3Iwm’Tt»r Pirv!>»o< r Ni’i-tiAWKer »E Intégration d’un moteur de workflow sur un environnement de grille entates et des suggestions sur mes travaux.Je tiens également à remercier Jean SALZEMANN. Vincent BLOCH. Ana Lucia DA COSTA. Geraldine PẺTTAHI et Matthieu REICHSTADT pour mavoir aide, m’avoir donné des conseils. des encouragements importants ainsi que pour leur gentillesse.Je remercie infiniment Dr. Intégration d’un moteur de workflow sur un environnement de grille Johan MONTAGNAT, chercheur au laboratoire I3S (polyteclTNice Sophia Antipolis) pour ses conseils précieux, son soutien tout au long de mon stage de fIntégration d’un moteur de workflow sur un environnement de grille
in d’etudes. Ce travail n’aurait pu être accompli sans son aide.Je voudrais exprimer un amical merci à 1'ensemble des membres de 1'équipe PCSV et des L’Institut de la Francophonie pour rinfonnatiqueLaboratoire de PhysiqueCoipusculaiie de Clermont-Ferrand# /V ÍP* 3Iwm’Tt»r Pirv!>»o< r Ni’i-tiAWKer »E Intégration d’un moteur de workflow sur un environnement de grille aussi aux professeurs à rinstitut de la Francophonie pour rinformatique (IFI) pour 111’avoir transnus de bonnes connaissances concernant le savoir et le savoir-faire qui sont utiles pour mon mémoire.Finalenient. j’exprime ma entière reconnaissance à ma famille. mes confreres, nies amis pour leurs s Intégration d’un moteur de workflow sur un environnement de grille outiens, aides, encouragements et conseils sincères.Hanoi, le 24 Octobre 2008TRAN Tuan TuTRAN Tuan Tu. IFI-P121Mẻinoire de tin d’etudeIntegration d’unIntégration d’un moteur de workflow sur un environnement de grille
moteur de workflow Stu-lln euvuoimeuient de grilleRésuméL'equipe Plate-forme de Calcul pour les Sciences du Vivant (PCSV) développe et dcploic dcpuisL’Institut de la Francophonie pour rinfonnatiqueLaboratoire de PhysiqueCoipusculaiie de Clermont-Ferrand# /V ÍP* 3Iwm’Tt»r Pirv!>»o< r Ni’i-tiAWKer »E Intégration d’un moteur de workflow sur un environnement de grille mplcmenlccs commc des scrv ices dont les laches corrcspondanlcs sonl cxcculccs sur la grille. Il est nécessaire d'integrer un gestionnaưe de workflow à la plateforme de 1'cquipc pour pcrmcllrc la creation ^interconnexions cnlrc scs diffcrcnls sendees et d'en permettre une execution et un enchainemen Intégration d’un moteur de workflow sur un environnement de grille t automatique. Les object! Is de cc stage sonl : (i) I'amclioration du molcur de work How nommc MOTEƯR pour qu'il puisse travailler avec les servicesIntégration d’un moteur de workflow sur un environnement de grille
de 1’équipe; (ii) La creation des work Hows pour soumettre Ct pour executor les laches; (iii) I.e dcveloppemcnt d'un senice bioinformatique specifiqueL’Institut de la Francophonie pour rinfonnatiqueLaboratoire de PhysiqueCoipusculaiie de Clermont-Ferrand# /V ÍP* 3Iwm’Tt»r Pirv!>»o< r Ni’i-tiAWKer »E Intégration d’un moteur de workflow sur un environnement de grille r de workflowAbstractFor the past 7 years, the Computing Platform Group for the Life Sciences (PCSV) has been developing and deploying biomedical applications on grid cnvronmcnl. In the computing platform of the group, these applications function as sendees whose corrcspoding tasks arc executed in t Intégration d’un moteur de workflow sur un environnement de grille he grid. I o perfom and link such sendees automatically and sequentially, an integration of a workflow management into this platform is needed. I hisIntégration d’un moteur de workflow sur un environnement de grille
thesis is, therefore, dedicated on : (i) Improving MOTE UR. a workflow engine, so that It can work with the sendees of the group, (ii) Creating the woL’Institut de la Francophonie pour rinfonnatiqueLaboratoire de PhysiqueCoipusculaiie de Clermont-Ferrand# /V ÍP* 3Iwm’Tt»r Pirv!>»o< r Ni’i-tiAWKer »E Intégration d’un moteur de workflow sur un environnement de grille coveryKeywords : grid. PCSV, bioinformatic, ẢÍOTEƯR, workflow. workflow engineTRAN Tuan Tu. IFI-P12L’Institut de la Francophonie pour rinfonnatiqueLaboratoire de PhysiqueCoipusculaiie de Clermont-Ferrand# /V ÍP* 3Iwm’Tt»r Pirv!>»o< r Ni’i-tiAWKer »EGọi ngay
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