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Optimisation par parallélisation de l’algorithme de recalage élastique 3d free form deformation ffd

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Optimisation par parallélisation de l’algorithme de recalage élastique 3d free form deformation ffd

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Optimisation par parallélisation de l’algorithme de recalage élastique 3d free form deformation ffd mediaOPTIMISATION PAR PARALLELISATION DE L’ALGORITHME DE RECALAGE ÉLASTIQUE 3D FREE FORM DEFORMATION (FFD)LE Xu an Sang5 décembre 2013Encadrants :Dr.

Thierry DELZESCAUX (CEA), Nicolas SOUEDET (CEA) Muriel VISANI (Université de La Rochelle)53mircen©PICSELRemerciementsJe souhaite tout d’abord remercie Optimisation par parallélisation de l’algorithme de recalage élastique 3d free form deformation ffd

r mon encadrant de stage, Thierry Delzescaux, pour m'avoir accueilli au sein de I'equipe. pour son soutien tout au long du stage, sa disponi-bilité, e

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t ses conseils nombreux et éclairés.Merci également à Nicolas Souedet pour m'avoir aide à me familiariser avec I'environ-nement de développement à MIR

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Optimisation par parallélisation de l’algorithme de recalage élastique 3d free form deformation ffd e biologiste et pour leur enthousiasme dans ma preparation des données de segmentation, une longue et fastidieuse tâche.Sans oublier Yael Balbastre et

Medhi Sadouni. mes amis du bureau 114. pour I’accueil chaleureux, pour I'ambiance de travail très amicalc et pour leurs blagues très drôles même si j Optimisation par parallélisation de l’algorithme de recalage élastique 3d free form deformation ffd

e ne les ai pas toutes comprises.Je tiens à remercier Muriel Visani, mon encadrant de 1‘université de La Rochelle, pour le suivi et les relectures du

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rapport au cours de mon stage.Merci enfin à Maryse Mouveroux pour m'avoir aide à résoudre toutes les demarches administratives difficiles qui ont perm

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Optimisation par parallélisation de l’algorithme de recalage élastique 3d free form deformation ffd . 52.2La recherche pré-dinique et les modeles animaux........................ 52.3Les differents types d'imagerie.....................................

... 62.3.1Imagerie post morterm........................................... 62.3.1.1Acquisition des données................................ 62.3.1.2Les Optimisation par parallélisation de l’algorithme de recalage élastique 3d free form deformation ffd

differentes types de deformations.................. 72.3.2Imagerie in vivo ............................................... 82.3.3La modalité photogra

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phique...................................... 92.4La reconstruction 3D de données post mortem........................... 102.5Le recalage 3D d'imagcs .

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Optimisation par parallélisation de l’algorithme de recalage élastique 3d free form deformation ffd e - le recalage FFD.................. 122.5.3Critères de similarité......................................... 142.5.4Critère de recouvrement DICE......

............................. 15 Optimisation par parallélisation de l’algorithme de recalage élastique 3d free form deformation ffd

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